华映、友达两大电子厂废水排放突然变更，引起桃园县与新竹县争议，忧心废水改排可能影响到四千顷农田、五十万人用水或更为严重的事件发生；这引发当地居民反弹，扬言北上拆环保署的招牌，眼看问题延宕一年多未能解决，环保署表示，本于中央政府权责，将介入审查，协调跨县市争议。

设在桃园县的华映与友达两大电子厂，过去十年，废水都排入新竹县内的宵里溪，不过98年经环评审查认定为饮用水水源，考虑社会、经济与环境影响后，决议已专管方式改排到桃园县老街溪。

不过桃园县环保局则认为，改排老街溪将影响沿线4千公顷农田与50万多人的用水，再加上废水水质没有达到放流水标准与灌溉水质标准，因此不核发许可。

废水改排爆发跨县市争端，环保署指出，由于争议已经延宕1年9个月，因此中央有必要介入审查。环保署水保处科长邱仁杰说：【理论上先跟桃园县政府依法申请排放许可，桃园县政府都一直没有核发，已经拖了1年9个月，新竹县政府就向我们署里面申请，这个排放具有跨县市争议，署里本来是中央政府权责，有义务来协调解决跨县市争议。】

忧心废水改排影响水资源，当地居民扬言问题再不解决，将北上拆环保署招牌，对此，环保署长沈世宏8月1日前往地方了解事件过程，居中协调，希望尽速解决争议。